2022年了，lncRNA还能发高分吗？（上篇）

随着高通量测序的发展，lncRNA的研究热度一直居高不下，大量lncRNA得到注释，其通过在转录、转录后水平及表观遗传方式调控基因的表达，参与机体的生长发育过程。

与lncRNA相关的研究一直是国自然的热点，但近年来也显现出趋于饱和的趋势，而ceRNA机制的研究更是多得泛滥，中标和文章发表都越来越困难，在这种情况下研究lncRNA怎么才能发高分文章呢？

今天，小编为大家整理了10篇近期发表的lncRNA相关高分文章，另附每篇文章的分子机制图和原文链接，有助于了解最新的lncRNA研究思路，感兴趣的文章可跳转具体链接研读全文。

1. Targeting Xist with compounds that disrupt RNA structure and X inactivation

Nature（IF 49.962）

Pub Date: 2022-03-30

分子机制：越来越多疾病与非编码RNA相关，而靶向这些RNA 将拓宽药物研发的化学空间。为了克服传统RNA药物低特异性的局限，该研究设计了一种基于亲和选择质谱的无偏筛选方式。该方式基于自动配体识别系统（Automated ligand identification system，ALIS），利用生物物理绑定技术，确定配体的亲和力强于10µM的靶物质，识别出可结合非编码RNA原型Xist的小分子，X1化合物具有药物样特征，可在体外和体内特异结合Xist的RepA基序，由此减少RepA的构象空间，最终阻断了X染色体失活的启动。X1的药物化学特性研究将有助于进一步促进其效力以及特异性，从而应用于X染色体失活的再激活以及X染色体连锁的相关疾病。这些研究结果有助于扩大药物筛选的靶标范围，更好地应对药物开发中的挑战。

原文链接：

https://www.nature.com/articles/s41586-022-04537-z

2. WTAP-mediated m6A modification of lncRNA NORAD promotes intervertebral disc degeneration

Nat Commun（IF 14.919）

Pub Date: 2022-03-18

分子机制： 在衰老的髓核细胞（NPC）中，下调的 KDM5a 增强了 WTAP 启动子的 H3K4me3 修饰并促进 WTAP 表达。WTAP 促进 lncRNA NORAD 的 m6A 修饰并通过 YTHDF2 识别诱导 NORAD 转录本的降解。较少的 NORAD 使其与RNA 结合蛋白 PUM1/2的结合减少，导致 PUM1/2 与 E2F3 mRNA 的更多结合，从而促进 E2F3 转录本的降解，促进 NPC 的衰老。这些研究结果提出了m6A调控介导的NPC衰老过程中的机制，揭示了中断NORAD m6A修饰或靶向NORAD/PUMILIO/E2F3轴可以减缓椎间盘退变 (IVDD)的进展，并进一步提供针对IVDD的表观遗传治疗策略。

原文链接：

https://www.nature.com/articles/s41467-022-28990-6

3. A non-coding RNA balancing act: miR-346-induced DNA damage is limited by the long non-coding RNA NORAD in prostate cancer

Mol Cancer（IF 27.401）

Pub Date: 2022-03-22

分子机制： miR-346 在前列腺癌（PC）细胞中诱导快速和广泛的 DNA 损伤——通过转录过度激活、R 环形成和复制压力导致检查点激活和细胞周期停滞。miR-346与基因组保护性 lncRNA NORAD 相互作用以破坏其与 PUM2 的相互作用，导致 PUM2 稳定并增加 DNA 损伤反应 (DDR) 转录本的转换。NORAD 表达和活性与较差的 PC 临床结果和活检 RNA-seq 研究中增加的 DDR 密切相关。相比之下，miR-346 与 PC 存活率的提高有关。NORAD 沉默使成熟的 miR-346 水平增加数千倍，NORAD能够拯救miR-346 诱导的 DNA损害。miR-346 使 PC 细胞对包括 PARP 抑制剂和化疗在内的 DNA 损伤药物敏感，并作为体内单一疗法诱导肿瘤消退，表明靶向 miR-346/NORAD 平衡是一种有效的治疗策略。这些研究结果表明miR-346 和 NORAD 之间的平衡作用调节 PC 中的 DNA 损伤和修复。在晚期 PC 和转录过度活跃的癌细胞中观察到的 NORAD 减少的情况下，miR-346 作为治疗剂可能特别有效。

原文链接：

https://molecular-cancer.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12943-022-01540-w/figures/6

4. WDR82-binding long noncoding RNA lncEry controls mouse erythroid differentiation and maturation

J Exp Med（IF 14.307）

Pub Date: 2022-04-04

分子机制：该研究通过深度RNA测序分析了16个小鼠造血细胞群的转录组，并鉴定了一种新型lncRNA Gm15915，其在红细胞相关的祖细胞和红细胞中高度表达。因此，将其命名为lncEry。研究人员还鉴定了一种新的 lncEry亚型，这是以前没有报道过的主要转录本。lncEry缺失导致红细胞生成受损，表明lncRNA在调节红细胞分化和成熟中发挥重要作用。机制上，lncEry与WDR82（WD重复蛋白82）相互作用以促进Klf1和珠蛋白基因的转录，从而分别控制红细胞生成的早期和晚期阶段。这些研究结果将lncEry确定为红细胞生成转录调控的重要参与者。

原文链接：

https://rupress-org.proxy.library.carleton.ca/jem/article/219/4/e20211688/213079/WDR82-binding-long-noncoding-RNA-lncEry-controls

5. Interaction of lncRNA MIR100HG with hnRNPA2B1 facilitates m6A-dependent stabilization of TCF7L2 mRNA and colorectal cancer progression

Mol Cancer（IF 27.401）

Pub Date: 2022-03-12

分子机制：MIR100HG的表达与EMT标记物密切相关，并作为EMT的阳性调节因子。MIR100HG在体外和体内均能维持西妥昔单抗耐药性，促进结直肠癌（CRC）细胞的侵袭和转移。hnRNPA2B1被鉴定为MIR100HG的结合蛋白。在机制上，MIR100HG通过与hnRNPA2B1相互作用，维持了TCF7L2的mRNA稳定性，TCF7L2是Wnt/β-catenin的主要转录激活因子。hnRNPA2B1在MIR100HG存在下识别TCF7L2 mRNA的m6A位点。TCF7L2反过来激活MIR100HG转录，形成正反馈调节回路。MIR100HG/hnRNPA2B1/TCF7L2轴在出现局部或远处转移或与西妥昔单抗耐药相关的疾病进展的CRC患者中得到增强。这些研究结果表明，MIR100HG是结肠癌中一种有效的EMT诱导剂，激活MIR100HG/hnRNPA2B1/TCF7L2反馈回路能够增强CRC对西妥昔单抗的耐药性和转移能力。

原文链接：

https://molecular-cancer.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12943-022-01555-3

2021年度国自然医学部国自32大科研热点的中标数统计如下：