1.电子商务的税务问题
税务，是一个国家重要的财政来源。由于电子商务的交易活动是在没有固定场所的国际信息网络环境下进行，造成国家难以控制和收取电子商务的税金。因此，在制定与电子商务有关的政策法规时，需要重新审视传统的税收政策和手段，建立新的有效的税收机制。
2.电子商务人才匮乏
电子商务的发展需要跨学科领域的复合型人才，这些人才既要掌握互联网技术，又要精通商务管理的知识。现代网络技术和通信技术日新月异，公众难以跟上知识和技术的发展步伐，而我国又是一个发展中国家，公众在互联网和电子商务方面的知识还非常欠缺。要促进电子商务的发展，必须在各个层次上普及上网技能和电子商务知识，才能在我国大规模推进电子商务，但我国目前非常缺乏高水平电子商务方面的复合型专业人才。电子商务技术的快速发展，使整个社会对电子商务专业人才的需求日益迫切。
3.物流配送问题
电子商务的本质不是电子而是商务，商务的核心内容是商品的交易，商品交易会涉及4个方面:商流、资金流、信息流、物流。其中商流、资金流与信息流这3种流的处理都可以通过计算机和网络通信设备实现。物流作为4种流中最为特殊的一种，具体指运输、存储、包装、装卸、配送、流通加工、物流信息处理等活动。少数无形或媒体类商品，可以直接通过网络传输的方式进行配送，而对于大多数商品和服务来说，物流仍要经由物理方式进行传输。物流配送是实现整个交易过程的最终保证，没有便捷的物流配送便没有真正意义上的电子商务。在我国现在还缺乏一个高效成熟的社会物流配送体系能够对实物的转移提供低成本的、及时的、便捷的服务。配送的成本过高、速度过慢是偶尔涉足电子商务的企业和个人最为不满的问题。
