本文转自:解放日报
20年覆盖300万人,拥有自主知识产权
中国代谢解析样本库向全球开放
黄杨子
本报记者 黄杨子
中国代谢解析计划(China Metabolic Analytics Project,英语缩写为China MAP)昨天在上海交通大学医学院附属瑞金医院宣布,将向世界开放积累了近20年的相关生物样本库。院方负责人介绍,11月14日恰逢世界糖尿病日,选择在这个时候宣布开放数据库,是希望更多人重视糖尿病,更多全球同行为攻克相关疾病携手奋斗。
随着大数据和人工智能时代的来临,组学数据在药物研发中起着极为关键的作用。瑞金医院内分泌团队从零起步,打造拥有自主知识产权的多组学数据分享平台以及分析平台“组学港”。从平台建立初始就将“共享、让世界共赴中国代谢新组学解析之约”作为宗旨。“希望建立起与国内外同行沟通的桥梁,助力全球同行共同为人类健康而努力。”中国工程院院士、瑞金医院院长宁光说。
瑞金医院内分泌代谢科主任王卫庆介绍,“组学港”平台将依托国家代谢性疾病临床医学研究中心(上海)近20年所积累的45万自然人群队列基础以及已收集的300万人生物大样本,打通组学数据检测、数据收集质控、数据整理入库、组学大数据分析及分析结果展示等一系列上下游关键节点,为“端到端”的组学数据服务提供关键的组学信息与分析方法支撑,相关成果已经申请软件著作权4项。
目前,平台已涵盖基因组、蛋白组、代谢组、肠道微生物组等丰富组学资源,并收集了超过1500种疾病与表型信息,随访超过10年时间。预计最终将涵盖超过1万种人类组学、表型、疾病信息,数据条数将超过2000万亿条。
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